Exacta – комплексний молекулярний тест

Ультраперсоналізоване лікування рефрактерного та метастатичного раку

Резистентні до лікування (рефрактерні) та метастатичні види раку становлять серйозну клінічну проблему, оскільки практично немає методів їх лікування, а прогноз неминуче несприятливий. Таким пацієнтам потрібні раціонально розроблені стратегії для вибору персоналізованих схем лікування, які оцінюють та враховують молекулярну та функціональну динаміку пухлини, тим самим ефективно впливаючи на вразливості пухлини та уникаючи заздалегідь відомих механізмів резистентності. Вибір комбінованих схем лікування протипухлинними препаратами може діяти синергічно, запобігаючи механізмам «втечі» злоякісних новоутворень та знижуючи рівень лікарської резистентності, що зменшує ризики неефективного лікування та пов’язаної з ним токсичності.

Exacta – малоінвазивний діагностичний тест, призначений для мультианалітичної ідентифікації геному пухлини та одночасної оцінки хіміочутливості in vitro на живих пухлинних клітинах з метою виявлення всіх можливих мішеней для вибору найбільш доречних терапевтичних варіантів на основі достовірного аналізу крові.

Exacta – це багатоаналітичне та багатокоординоване дослідження інтерактома пухлини, яке дозволяє ідентифікувати найефективніші препарати для будь-якого конкретного типу раку та розробляти найскладніші ультраперсоналізовані стратегії лікування, зокрема для метастатичних та рефрактерних (резистентних) форм. Рекомендоване лікування не залежить від первинного органу походження, гістологічного типу/підтипу, морфології (ступеню злоякісності) або агресивності пухлини, а ґрунтується виключно на доведеній ефективності препаратів для конкретної пухлини пацієнта. Препарати з найбільшим потенціалом для клінічного успіху відбираються шляхом тестування in vitro на живих клітинах пухлини пацієнта з урахуванням еволюції раку. Це виключає будь-які «експерименти» над організмом пацієнта та позбавляє його від зайвої токсичності та витрати дорогоцінного часу на неефективне лікування.

Сфера застосування

Оптимальна цитотоксична терапія
Визначення хіміочутливості in vitro на живих пухлинних клітинах. Оцінка відповіді/резистентності до цитотоксичних препаратів на основі аналізу ДНК та експресії генів

Оптимальна таргетна терапія
Ідентифікація найбільш вразливих молекулярних мішеней пухлини шляхом комплексного молекулярного аналізу всіх специфічних біомаркерів (мутацій, делецій, перебудов, ампліфікацій та експресії генів). Подальший аналіз одночасного впливу молекулярних характеристик опору та сприйнятливості

Оптимальна імунотерапія
Аналіз клінічних біомаркерів, таких як PD-L1, пухлинне навантаження та мікросателітна нестабільність

Токсичність та побічні реакції препарату
Прогнозування побічних реакцій і токсичності лікарських засобів на основі аналізу генетичних поліморфізмів ферментів біотрансформації лікарських засобів

Повторне використання ліків
Аналіз додаткових терапевтичних варіантів у випадках рецидивуючого або прогресуючого високодиференційованого раку, незважаючи на попередню терапію

Методологія

Exacta оцінює:

• основні елементи та характеристики молекулярного та функціонального інтерактома, що підтримують та стимулюють розвиток злоякісної пухлини, тобто молекулярні збурення та їх динаміка;
• функціональну хіміочутливість/резистентність, що є результатом загальної молекулярної динаміки.

Цільові гени
Однонуклеотидні варіації (SNV), варіації кількості копій (CNV), інсерції та делеції (Indels), мутаційне навантаження, мутації зародкової лінії

Секвенування РНК
Шляхи KEGG, пов'язані із захворюваннями, терапевтичними моделями та моделями резистентності

Фармакогенетика
Генотипування CYP450, транспортних білків, для оцінки ефективності та токсичності

Хіміочутливість
Аналіз in vitro на живих пухлинних клітинах для оцінки цитотоксичних препаратів

Імуноцитохімія
Аналіз експресії терапевтично значущих білкових маркерів (mTOR, VEGFR1, VEGFR2, VEGFR, EGFR)

Рідка біопсія
Мутаційне навантаження, гетерогенність пухлини

Доведена клінічна ефективність

Високу клінічну ефективність було переконливо підтверджено в дослідженні/протоколі RESILIENT (CTRI/2018/02/011808). Протокол RESILIENT – це перше та єдине у світі проспективне дослідження в прецизійній онкології, в якому комбінації препаратів були обрані на основі багатоаналітичної інтеграції.
У дослідженні взяли участь пацієнти з рецидивуючими, рефрактерними, метастатичними злоякісними епітеліальними новоутвореннями, у яких спостерігалася прогресія захворювання після ≥2 ліній системного лікування. Первинними кінцевими точками були: якість життя (QoL), виживаність без прогресування захворювання (PFS) та об’єктивна відповідь (ORR).

У 90,5% пацієнтів подальше поширення раку було ефективно зупинено, а у 42,9% випадків лікування призвело до значного зменшення поширення раку. Не повідомлялося про серйозні побічні ефекти чи смертельні випадки, пов'язані з лікуванням. Більшість пацієнтів повідомляли про стабільну або покращену якість життя.

Вказівки:

• неефективність терапії першої лінії;
• високозлоякісний/метастатичний рак;
• нещодавно діагностоване захворювання, яке важко лікувати;
• високий ризик терапевтичної невдачі;
• рецидив раку;
• рак з обмеженими/без стандартних варіантів лікування;
• складні види раку, такі як шлунок, стравохід, підшлункова залоза, жовчний міхур, ГІСПО та інші.

Різні діагностичні рішення

	ТОЧНИЙ КОМПЛЕКСНИЙ АНАЛІЗ КРОВІ	ТОЧНИЙ КОМПЛЕКСНИЙ АНАЛІЗ КРОВІ ТА ТКАНИН	ТОЧНИЙ БАЗОВИЙ АНАЛІЗ КРОВІ	ТОЧНИЙ БАЗОВИЙ АНАЛІЗ КРОВІ ТА ТКАНИН
Проаналізовані гени	411 генів	511 генів	411 генів	511 генів
Перебудови генів	12 генів	51 генів	12 генів	51 генів
Ампліфікація генів	409 генів	354 гени	409 генів	354 гени
Хіміочутливість до цитотоксичних препаратів	29 препаратів	29 препаратів	29 препаратів	29 препаратів
Аналіз експресії mTOR, EGFR, VEGFR1, VEGFRFA, VEGFR2 за допомогою ICC	+	+	+	+
Експресія генів: 20 800 генів	+ (екзосомний)	+ (тканина)
Пухлинний мутаційний тягар (TMB)	+ (бТМБ)	+ (ТМБ)	+ (бТМБ)	+ (ТМБ)
Аналіз генів мікросателітної нестабільності/MMR	Секвенування зародкової лінії генів MMR	+ (MSI)
ІГХ-аналіз		+
ІГХ-аналіз AR, PD-L1 28-8 та 22C3 (для всіх солідних пухлин)		+
ІГХ-аналіз HER2 (рак молочної залози, ендометрію, стравоходу/шлунка, товстої кишки, жовчного міхура)		+
Аналіз ендометрію, ректального тиску, імуноглобуліну (ІГХ) (молочні залози, яєчники, ендометрій)		+
Кількість циркулюючих пухлинних клітин	+	+	+	+
HMAF на базі LB	+	+	+
Фармакогенетичне керівництво	+	+
Одночасний аналіз тканинної ДНК та вільної клітинної ДНК		+
Секторальне секвенування генів BRCA1/2		+		+
Аналіз BRCA1/2 MLPA (молочна залоза/яєчник/підшлункова залоза/простата)	+	+
Додаткові речовини	На основі РНК ± хіміочутливість	На основі РНК ± хіміочутливість	Необов’язково	Необов’язково